ASÍ CREAN LOS VIRUS

 ASÍ CREAN LOS VIRUS 

Los CDC "CREAN" secuencias completas con programas informáticos a partir de muestras de pacientes. 

NO EXISTE NINGUNA SECUENCIACIÓN GENÓMICA COMPLETA "NATURAL" EXTRAÍDA DEL SUPUESTO VIRUS DE LAS MUESTRAS

"los CDC completan la secuenciación genómica de aproximadamente 7 000 virus de la influenza a partir de muestras clínicas originales obtenidas mediante la vigilancia virológica"

Secuenciación genómica y caracterización genética del virus de la influenza

https://espanol.cdc.gov/flu/about/professionals/genetic-characterization.htm 

Secuenciación genómica

Los dos tipos de influenza (A y B) que causan epidemias estacionales tienen ocho segmentos de genes de ARN. Estos genes contienen "instrucciones" para fabricar virus nuevos y así propagar la infección. Las proteínas en la superficie de un virus de la influenza, la hemaglutinina (HA) y la neuraminidasa (NA), determinan propiedades importantes del virus y están incluidas en la mayoría de las vacunas de cada temporada, y por eso se analizan más detalladamente. En un año típico, los CDC completan la secuenciación genómica de aproximadamente 7 000 virus de la influenza a partir de muestras clínicas originales obtenidas mediante la vigilancia virológica.

Caracterización genética

Los CDC y otros laboratorios de salud pública de todo el mundo han secuenciado los segmentos genéticos de los virus de la influenza desde la década de 1980. Los CDC aportan secuencias genéticas para las bases de datos públicos, como GenBankícono de sitio externo y la Iniciativa Global para Compartir Datos sobre la Gripe Aviar (GISAID)ícono de sitio externo, para que los investigadores y científicos de salud pública las analicen. Las secuencias depositadas en estas bases de datos permiten a los CDC y otros investigadores comparar los genes de los virus de la influenza actualmente en circulación con los genes de virus de la influenza anteriores, y los que se utilizan en las vacunas. El proceso de comparar las secuencias genéticas se llama caracterización genética.

Métodos de secuenciación genómica de la influenza

 Debido a la naturaleza constantemente cambiante de los virus de la influenza, cada muestra obtenida de un paciente contiene muchas partículas de virus de la influenza con pequeñas diferencias genéticas entre sí.

 Tradicionalmente, los científicos han utilizado la técnica de secuenciación conocida como "el método Sanger" para monitorear la evolución de la influenza como parte de la caracterización genética. El método de secuenciación Sanger(1) identifica la secuencia genética predominante entre los muchos virus de la influenza presentes en la muestra del virus. Esto quiere decir que las pequeñas variaciones en la población de virus presentes en una muestra no se ven reflejadas en el resultado final. Las nuevas tecnologías (como la secuenciación de próxima generación, que se describe más abajo) permiten detectar mejor pequeñas variaciones en los genes de los virus y ofrecen ventajas para la secuenciación genómica completa.

 En un año típico, los CDC completan la secuenciación genómica de aproximadamente 7 000 virus de la influenza a partir de muestras clínicas originales obtenidas mediante la vigilancia virológica. La NGS utiliza la detección molecular avanzada (AMD) para identificar las secuencias de genes de cada uno de los virus que componen una muestra. Por consiguiente, la NGS revela las variaciones genéticas entre muchas partículas diferentes del virus de la influenza en una misma muestra y puede aumentar la velocidad y precisión de la secuenciación de cada una de las regiones de codificación de las proteínas del virus. Este nivel de detalle puede beneficiar directamente la toma de decisiones de salud pública de maneras importantes, pero la interpretación de los datos debe ser cuidadosa y en el contexto de otra información disponible, y estar a cargo de expertos capacitados. Vea Proyectos AMD: mejorar las vacunas contra la influenza para obtener más información sobre cómo la NGS y la AMD están revolucionando el esquema del genoma de la influenza en los CDC.

 

 https://genotipia.com/sanger/

(1)Método de Sanger o de los dideoxinucleótidos   

Esta estrategia se basa en sintetizar, de forma secuencial, una hebra de ADN complementaria a una hebra de cadena simple (que se utiliza como molde), en presencia de ADN polimerasa, los cuatro 2’-deoxinucleótidos que componen la secuencia del ADN (dATP, dGTP, dCTP y dTTP) y cuatro dideoxinucleótidos (ddATP, ddGTP, ddCTP y ddTTP).